Fils aîné de Jean de Borgia, duc de Gandie, et de Jeanne d’Aragon, François naquit en 1510, perdit sa mère à 10 ans, et fut élevé par son oncle, archevêque de Saragosse. Placé à la cour de l’empereur Charles-Quint, le jeune prince épousa la vertueuse Eléonore de Castro, dont il eut cinq enfants. Un glorieux avenir s’ouvrait devant lui, quand la mort de l’impératrice Isabelle, en 1539, changea complètement le cours de ses idées. Vivement impressionné par les ravages de la mort sur le cadavre de l’illustre princesse, François résolut de fuir l’ambition, l’envie et le plaisir, ces trois fléaux des cours. Nommé vice-roi de Catalogne, il mena la vie d’un très grand chrétien, soucieux de dérober aux regards des siens les austérités qu’il pratiquait. Son épouse étant morte, il entra dans la Compagnie de Jésus, qu’il avait connue par des rencontres avec Ignace de Loyola et ses premiers compagnons. Il refusa la pourpre cardinalice, fut pendant plusieurs années commissaire général des Jésuites en Espagne, y établit de nouvelles maisons, non sans difficulté. Devenu troisième général de son Ordre, il contribua beaucoup à l’affermir et à le propager. François de Borgia mourut le 30 septembre 1572, avec la sérénité confiante de l’homme qui a toujours fait son devoir.